Pomidor Qəhvəyi Rugose Meyvə Virusu bütün dünyada pomidor və bibər bitkilərini yoluxdurduğu üçün toxum şirkətləri davamlı pomidor yetişdirmək üzərində işləyirlər.
Zəngin genetik və genomik ehtiyatlar pomidor yetişdiriciləri üçün hələ pomidorun genomik ardıcıllığı layihələrinin başlanmasından əvvəl mövcud idi. Böyük pomidor germplazma kolleksiyaları bir neçə yerdə çoxdan yaradılmışdır. Dünya üzrə genbanklarda 75,000 XNUMX-dən çox pomidor əlavəsi qorunur. Ən böyüklərindən biri Cenevrə, NY-da USDA genbankıdır.
Pomidor genomunun ardıcıllaşdırılması 2005-ci ildə 14 ölkə arasında çoxmillətli bir iş olaraq başladılıb və 2012-ci ildə tamamlanıb. Böyük miqdarda genetik və fenotipik məlumatların təhlili üçün süni intellekt, maşın öyrənməsi və qabaqcıl alqoritmlərin tətbiqi ilə bu səylər xeyli sürətlənib.
Pomidor Pan-Genomu
2020-ci ildə Boyce Thompson İnstitutunun tədqiqatçıları daha tam və faydalı pomidor pan-genomu istehsal etmək üçün vəhşi pomidorlar üçün yüksək keyfiyyətli istinad genomu yaratdılar. Onlar genomun meyvə ləzzətinin, ölçüsünün və yetişməsinin, stresə dözümlülüyün və xəstəliyə qarşı müqavimətin əsasını təşkil edən bölmələrini aşkar ediblər. Qismən çox uzun DNT parçalarını oxuya bilən qabaqcıl ardıcıllıq texnologiyaları sayəsində istinad genomu mövcud verilənlər bazasından daha tam və dəqiqdir.
Daha qısa DNT hissələrini oxuyan köhnə ardıcıllıq texnologiyaları tək baza səviyyəsində mutasiyaları müəyyən edir. Bununla belə, onlar DNT-nin böyük hissələrinin daxil edilməsi, silinməsi, inversiyaları və ya dublikasiyası kimi struktur variantlarını tapmaqda yaxşı deyillər.
2019-cu ildə beynəlxalq tədqiqatçılar qrupu 725 filogenetik və coğrafi cəhətdən təmsil olunan sortların genom ardıcıllığından istifadə edərək pomidor pan-genomu qurdular. Bu verilənlər bazasına orijinal istinad genomunda tapılmayan 4,873 gen daxildir. Mövcud/yox variasiya təhlilləri pomidorun əhliləşdirilməsi və təkmilləşdirilməsi zamanı əhəmiyyətli gen itkisini və genlərin və promotorların intensiv mənfi seçimini aşkar etdi.
Tam məqaləni www.seedworld.com saytında oxuyun.